เนื่องจากไม่ค่อยมีใครรู้เกี่ยวกับสาเหตุของอาการลำไส้แปรปรวน จึงไม่มีทางป้องกันไม่ให้เกิดขึ้นได้

การเปลี่ยนแปลงของอาหารและการจัดการที่ดีขึ้นของ ความเครียด อาจช่วยลดความรู้สึกไม่สบายได้ (ดูหัวข้อการรักษาพยาบาล)